Therion tiene sus orígenes en la localidad de Upplands Väsby, Suecia, bajo el nombre original de Blitzkrieg. Fundada por Christofer Johnsson, quien en aquel entonces asumía los roles de bajista y vocalista principal a pesar de su corta experiencia con el instrumento, la banda dio sus primeros pasos con una alineación que incluía al guitarrista Peter Hansson y al baterista Oskar Forss. Las influencias iniciales del grupo estaban profundamente arraigadas en el thrash metal de bandas como Metallica y Slayer, aunque su sonido crudo también evocaba la agresividad de Venom y Motörhead. A pesar de su energía, Blitzkrieg tuvo una vida corta: tras solo dos conciertos y sin grabaciones oficiales, la banda se disolvió en 1988 debido a conflictos internos.

No obstante, el espíritu creativo de Johnsson no se detuvo. Ese mismo año, el grupo se reformó bajo el nombre de Megatherion, título inspirado en el emblemático álbum To Mega Therion de los suizos Celtic Frost, quienes se convirtieron en una influencia determinante para el nuevo rumbo sonoro. Johnsson decidió cambiar el bajo por la guitarra, y tras varios ajustes en la alineación —que incluyeron el regreso de Oskar Forss y la incorporación momentánea de Erik Gustafsson— el nombre se acortó definitivamente a Therion. En 1989, la banda comenzó a dejar su huella en el underground con las maquetas Paroxysmal Holocaust y Beyond the Darkest Veils of Inner Wickedness, seguidas en 1990 por el EP Time Shall Tell. Este último, aunque técnicamente una demo, logró una distribución de mil copias que atrajo la atención de Deaf Records, sello con el que lanzarían su álbum debut.

En 1991 vio la luz Of Darkness..., un disco compuesto por temas que Johnsson había escrito durante los años ochenta. Este trabajo es recordado hoy como una pieza fundamental del death metal progresivo, integrando estructuras complejas y una temática lírica marcadamente política y social, influenciada por la escena punk hardcore y el grindcore de la época. Sin embargo, la relación con Deaf Records era tensa, lo que llevó a la banda a firmar con Active Records para su segundo esfuerzo, Beyond Sanctorum (1992). En este álbum, Therion comenzó a romper las fronteras del género, introduciendo teclados y voces limpias de forma sutil, marcando el inicio de su naturaleza experimental.

La estabilidad de la banda siempre fue precaria. Tras la salida de Hansson por motivos de salud y de Forss, Johnsson reclutó a Piotr Wawrzeniuk, Magnus Barthelsson y Andreas Wahl. Con este equipo grabaron en 1993 Symphony Masses: Ho Drakon Ho Megas, una obra que se alejó del death metal para explorar el doom metal, el jazz, la música industrial y los cánticos religiosos. Fue una etapa de dificultades económicas profundas para los músicos, quienes a pesar de su creciente estatus de culto, apenas lograban subsistir. La suerte cambió cuando, tras la desaparición de Active Records, la banda firmó con el gigante del metal Nuclear Blast en 1994, una alianza que perdura hasta el presente.

El primer lanzamiento bajo Nuclear Blast fue Lepaca Kliffoth (1995), precedido por el sencillo «The Beauty in Black». Este disco supuso un salto cuántico, incorporando por primera vez a cantantes de ópera profesionales (sopranos y barítonos). Johnsson también transformó su estilo vocal, alejándose de los guturales tradicionales. Sin embargo, la verdadera obra maestra llegó en 1996 con Theli. Este álbum, grabado con la colaboración de dos coros completos y el aporte vocal de Dan Swanö, definió el sonido del metal sinfónico moderno. El uso extensivo de teclados fue tan notorio que se le apodó irónicamente como la «Orquesta Sinfónica de Barmbek». Theli fue un éxito rotundo, duplicando las ventas de su predecesor y elevando a Therion a la cima del metal europeo.

A pesar del éxito, las tensiones internas continuaron. Problemas de alcoholismo en miembros como Jonas Mellberg y Lars Rosenberg forzaron nuevas reestructuraciones. A esto se sumó el lanzamiento de A'arab Zaraq - Lucid Dreaming en 1997, un disco misceláneo que incluía descartes, versiones y la banda sonora compuesta por Johnsson para el cortometraje «The Golden Embrace».

En 1998, Therion lanzó Vovin, un álbum que marcó otro hito al utilizar, por primera vez, una orquesta de cuerdas real y un coro profesional de gran escala. Con la participación de las sopranos Martina Hornbacher y Sarah Jezebel Deva, el disco vendió más de 150,000 copias solo en Europa. La banda consolidó una formación más estable con la llegada del baterista Sami Karppinen y los hermanos Kristian y Johan Niemann en las guitarras y el bajo, respectivamente. A este éxito le siguieron el miniálbum Crowning of Atlantis (1999) y el ambicioso Deggial (2000), donde Johnsson empleó orquestaciones aún más complejas, consolidando su transición de compositor de metal a director de arreglos sinfónicos.

En 2001, la banda exploró sus raíces culturales con Secret of the Runes, un álbum conceptual basado en los nueve mundos de la mitología nórdica. Este disco fue grabado en su propio estudio, «Modern Art», y recibió elogios unánimes de la crítica especializada. Para celebrar su 15.º aniversario, lanzaron el disco en vivo Live in Midgård, capturando la energía de la gira mundial.

El punto culminante de la productividad de Johnsson llegó en 2004 con el lanzamiento simultáneo de los álbumes hermanos Sirius B y Lemuria. Para este proyecto, la banda contó con la impresionante cifra de 171 músicos, incluyendo un coro de 32 voces grabado en Praga. Estos discos presentaron un sonido más orientado a las guitarras y melodías pegadizas, contando con el regreso de Piotr Wawrzeniuk y la incorporación de Mats Levén. La gira promocional fue colosal, abarcando 106 conciertos durante dos años y culminando en 2006, marcando también el retiro de Christofer Johnsson como vocalista principal para centrarse en la composición y la dirección.

Los años siguientes estuvieron marcados por la edición del box-set Celebrators of Becoming y el lanzamiento de Gothic Kabbalah en 2007, un álbum que exploró matices más progresivos y góticos, alejándose ligeramente de las orquestaciones masivas de los discos previos. Durante este periodo, Therion también se aventuró en ambiciosos proyectos en vivo que fusionaban el metal con la música clásica de grandes compositores como Dvořák, Verdi, Mozart y Wagner. El espectáculo «Therion Goes Classic» en Bucarest y su participación en el Festival de Ópera de Miskolc en Hungría —con Lori Lewis como vocalista— quedaron registrados en The Miskolc Experience (2009), demostrando que la banda había trascendido los límites del género para convertirse en una entidad artística única en el mundo.

Entre noviembre y diciembre de 2007, Therion celebró su 20.º aniversario con una gira de 16 conciertos por Europa. El repertorio incluyó las dos partes de «Kali Yuga», el álbum Theli interpretado íntegramente y «Adulruna Rediviva», además de canciones elegidas mediante votación de los seguidores. En algunos conciertos participaron el teclista Ferdy Doernberg, una bailarina de danza del vientre y los exvocalistas Piotr Wawrzeniuk y Mats Levén. El concierto de Budapest fue grabado para un DVD, aunque su lanzamiento quedó indefinidamente pospuesto.

En 2008, Therion anunció la separación de su núcleo de músicos, aunque Christofer Johnsson aseguró que la banda continuaría. Johan Koleberg asumió la batería y Nalle Påhlsson el bajo. Ese año la banda solo ofreció un concierto, en un festival celebrado en Płock, Polonia.

Tras la publicación de The Miskolc Experience en 2009, Thomas Vikström fue presentado como nuevo vocalista principal. La banda comenzó a trabajar en Sitra Ahra, con la incorporación del guitarrista Christian Vidal y la participación de Snowy Shaw como cantante. El álbum fue lanzado el 17 de septiembre de 2010 y estuvo acompañado por giras por América del Sur, América Central y Europa.

En 2011, la cantante Katarina Lilja dejó nuevamente la banda, mientras que Linnéa Vikström colaboró como corista en el festival Bloodstock Open Air. Therion participó en importantes festivales como Hellfest, ProgPower USA y 70000 Tons of Metal. Ese mismo año Lori Lewis pasó de ser colaboradora a integrante oficial de la banda y también se publicó el juego de mesa «011», inspirado en Sitra Ahra.

En febrero de 2012, Therion anunció la grabación de un nuevo disco y una gira por su 25.º aniversario. El resultado fue Les Fleurs du Mal, publicado en septiembre a través del sello propio de Johnsson, Adulruna, en lugar de Nuclear Blast. El álbum fue concebido como un proyecto artístico que combinó música, ilustraciones y videoclips, e incluyó versiones de canciones francesas y temas pop adaptados al estilo de la banda. Ese mismo día comenzó la gira conmemorativa por Europa.

Poco después, Johnsson anunció que dedicaría sus esfuerzos a una ópera rock metal, lo que implicaría reducir las giras y la publicación de nuevos álbumes. Sin embargo, en 2013 reconsideró esta decisión y organizó la gira «Rock Opera Unveiled Tour» para presentar el nuevo material y conocer la reacción del público.

En 2014 se publicaron dos lanzamientos: una edición especial de Theli con material adicional y el DVD Adulruna Rediviva and Beyond, que reunió el concierto del aniversario de 2007 y una actuación de 2011. Ese año continuó la gira de la ópera rock por Latinoamérica. Lori Lewis dejó de participar en los conciertos por motivos personales, aunque permaneció como miembro para las grabaciones de estudio. Fue sustituida en directo primero por Sandra Laureano y, posteriormente, por Isa García Navas y Chiara Malvestiti, debido a las exigencias vocales del repertorio.

En 2015, Johnsson impulsó el proyecto paralelo Luciferian Light Orchestra, inspirado en el rock ocultista de los años setenta. El grupo publicó un álbum homónimo Luciferian Light Orchestra y actuó como telonero de Therion durante varias giras. Además, Therion ofreció sus primeros conciertos acústicos en América Latina y en Bucarest. Tanto este proyecto como otros lanzamientos relacionados fueron editados por Adulruna.

En noviembre de 2016, Johan Koleberg abandonó la banda y fue reemplazado temporalmente por Fredrik Andersson. Un año después, Sami Karppinen regresó oficialmente como baterista. Durante ese periodo, Johnsson reveló que padecía dos hernias discales provocadas por años de actuaciones intensas, lo que obligó a retrasar el proyecto de la ópera rock y reducir el repertorio en vivo. Gracias a la fisioterapia evitó la cirugía y pudo retomar las presentaciones en festivales. También realizó la orquestación de un espectáculo de Sabaton con orquesta sinfónica.

En agosto de 2017 se anunció Beloved Antichrist, una ambiciosa ópera rock inspirada parcialmente en El cuento del Anticristo, de Vladimir Soloviev. La obra, con más de tres horas de duración y 29 personajes vocales, fue publicada finalmente el 9 de febrero de 2018. Ese año Therion emprendió una extensa gira por Europa, América Latina, China y, por primera vez, Australia. Al finalizar la gira, Linnéa Vikström dejó la formación y fue reemplazada por Rosalía Sairem.

En 2019, Nalle Påhlsson dejó de participar en las giras para concentrarse en la composición y las grabaciones de estudio. Justin Biggs ocupó su lugar en el único concierto restante de ese año.

Entre 2021 y 2023, Therion publicó la trilogía Leviathan: el primer álbum apareció en enero de 2021, el segundo en octubre de 2022 y Leviathan III en diciembre de 2023, ya bajo el sello Napalm Records. En los festivales de 2022 Johan Koleberg volvió temporalmente a la batería, mientras Sami Karppinen actuaba con Opeth. Una gira europea prevista para ese año fue cancelada debido a problemas con la agencia de contratación y al aumento de los costes. En su lugar, la banda realizó algunos conciertos en Malta, Grecia y Turquía, seguidos de una extensa gira latinoamericana que incluyó 18 actuaciones en México.

Tras completar la trilogía, Therion realizó una gira por Europa y China en 2024. Debido al embarazo de Chiara Malvestiti, Lori Lewis regresó como cantante de gira. Antes de iniciar el recorrido, la banda ofreció en Ciudad de México su tercer concierto junto a una orquesta y coro, interpretando principalmente composiciones propias. Posteriormente realizó una segunda etapa por Turquía y América Latina.

El 30 de enero de 2026, Therion publicó Con Orquesta a través de Napalm Records. El álbum recoge arreglos orquestales del concierto ofrecido en 2024 junto a la Orquesta Sinfónica Nacional de México. Para este proyecto, Christofer Johnsson contó con la colaboración del director Rodrigo Cadet y del compositor Bernardo Lorentze, consolidando una vez más la estrecha relación de la banda con la música sinfónica.